石榴等陆生植物Actin1基因密码子偏向性与进化分析

作者：王英; 张太奎; 张孟伟; 赵玉洁; 袁伟程; 刘翠玉; 苑兆和^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(06): 1799-1807.

DOI：10.13271/j.mpb.018.001799

• 石榴(Punica granatum)
• 陆生植物
• Actin1基因
• 密码子使用偏好性
• 进化分析

肌动蛋白Actin1基因参与构成植物细胞骨架,功能域高度保守,在植物系统演化中具有特殊作用,是重要的管家基因。本研究选取石榴等63种具有重要经济价值或生态价值的陆生植物Actin1基因,分析其密码子使用偏好性和进化。研究结果表明:石榴Actin1基因有效密码子值为46.809,密码子使用偏性较弱。石榴Actin1基因同义密码子相对使用度大于1的密码子大部分偏向于使用以G/C结尾,其偏性主要是由于自然选择压力影响。石榴等陆生植物的Actin1基因偏向使用AAC、GAU、CAG、GAG密码子,这种偏向性在陆生植物之间属于趋同进化模式,亲缘关系相近的物种对Actin1基因密码子使用模式相似。由63种陆生植物的Actin1基因密码子偏性分析证实与物种密码子偏性与其进化及亲缘关系相关。本研究通过对石榴等陆生植物Actin1基因密码子偏向性与进化分析为Actin1基因家族的后续研究提供理论参考。

• 单位
  南京林业大学; 南方现代林业协同创新中心