广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析

作者：朱冰; 钟家禹; 李潇; 陈翊; 林涛; 吴灶和; 周荣; 龚四堂

来源：中华微生物学和免疫学杂志, 2006, (10): 926-928.

• 星状病毒
• 基因组
• 4型基因型
• 序列分析 Human astrovirus
• Genome
• Genotype 4
• Sequence analysis

目的探讨广州地区儿童感染的星状病毒基因组分子结构特点和基因型。方法参考GenBank上的星状病毒基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增星状病毒基因组,克隆于T载体上,序列测定,用Clustal W和DNAStar软件分析基因组序列。结果星状病毒HASTVgz01全基因组为6721bp,提交到GenBank上的序列号为DQ344027,其中5′端非编码区(5′UTR)长82bp,3′端非编码区末端长81bp,病毒基因组编码区全长6558个核苷酸,分别编码ORF1a、ORF1b、ORF2,ORF1a基因长2763bp(83～2845nt),ORF1b基因长1557bp(2785～4332...

• 单位
  中国科学院南海海洋研究所; 广州市妇女儿童医疗中心