DNA条形码技术在淫羊藿属植物分类鉴定中的可行性分析

作者：严福林; 孙庆文; 任得强; 徐文芬; 魏升华; 何顺志^*

来源：中华中医药学刊, 2021, 39(03): 69-262.

DOI：10.13193/j.issn.1673-7717.2021.03.018

• 淫羊藿属
• psbA-trnH
• matK
• 分类鉴定
• DNA条形码

目的拟探讨基于叶绿体基因片段psbA-trnH与matK序列的DNA条形码技术在淫羊藿属中的分类与鉴定中的可行性。方法选用不同来源的34个种,共计84份材料,对其psbA-trnH与matK序列片段进行PCR扩增、测序,分析其序列组成和结构特点,应用Kimura双因素模型(Kimura-2-parameter, K-2-P)计算遗传距离,同时应用邻接法(Neighbor-Joining, N-J)构建系统发育树。结果 PsbA-trnH序列在34种淫羊藿属材料中的通用性较matK好;通过K-2-P模型评估,psbA-trnH鉴定成功率为36.7%,matK鉴定成功率为24.2%,2条序列遗传距离均存在一定gap; N-J进化树显示,matK序列N-J系统进化树鉴定效率为17.1%,psbA-trnH序列N-J系统进化树鉴定效率为25.7%。结论本研究丰富了淫羊藿属植物的分类鉴定资料,但在淫羊藿属中的分类与鉴定中,应用基于叶绿体基因片段psbA-trnH与matK序列的DNA条形码技术仍具有一定局限性。

• 单位
  贵州医科大学; 贵州中医药大学