南瓜转录因子基因CmRAV的克隆与表达分析

作者：李庆飞; 王梦梦; 郭卫丽; 周俊国; 李新峥^*

来源：植物生理学报, 2021, 57(12): 2337-2345.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2021.0144

• 中国南瓜
• CmRAV
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• 亚细胞定位

AP2/ERF转录因子家族是植物特有的最大转录因子家族,其家族成员参与植物发育及病原菌防御调控。前期转录组研究发现南瓜AP2/ERF转录因子家族成员在南瓜雌花正常及败育材料中差异表达。本研究对1个显著差异AP2/ERF转录因子基因进行了同源克隆、生物信息学分析以及亚细胞定位。研究结果显示,该基因CDS全长1 029 bp,编码342个氨基酸;蛋白序列包含1个AP2和1个B3结构域,属于AP2/ERF转录因子RAV亚家族,命名为CmRAV基因,该蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成;该蛋白无跨膜结构和信号肽; CmRAV蛋白质等电点为9.04,分子量为38.32 kDa,为亲水性不稳定蛋白。多序列比对和系统进化树分析结果显示, CmRAV蛋白序列与美洲南瓜、印度南瓜、甜瓜和黄瓜的RAV氨基酸序列一致性较高,中国南瓜与美洲南瓜亲缘关系最近。通过水稻原生质体亚细胞定位分析,发现该蛋白位于细胞核。表达分析结果显示,该基因在花不同结构及叶片中都具有较高的表达。

• 单位
  河南科技学院