细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析

作者：杜小迪; 侯巍; 苏中华; 马青梅; 何雪; 华瑞其; 阳爱国^*; 杨光友^*

来源：畜牧兽医学报, 2023, 54(06): 2605-2618.

• 细粒棘球绦虫
• 泛素结合酶基因家族
• 生物信息学
• 转录水平分析

本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平，为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息，对EgE2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Protoscolex, PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个EgE2s基因，更正了两个原序列有误的EgE2s,分别为EgE2L3(登录号：MZ277618);EgE2J1(登录号：MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明EgE2s高度保守。qRT-PCR结果显示，EgE2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异，其中EgE2A(P<0.001)、EgE2J1(P<0.01)在PSCs阶段高表达。B细胞抗原表位预测表明EgE2N的139-157区域位于EgE2s保守基序外。同时，T细胞抗原表位预测表明EgE2N与人和犬MHCⅠ类分子各有两个强结合位点，且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上，EgE2A和EgE2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用。EgE2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。

• 单位
  四川农业大学; 海晏县畜牧兽医站; 四川省动物疫病预防控制中心