欧李AP2基因家族的鉴定与表达分析

作者：张晓旭; 郭彩珍; 穆霄鹏; 郭夕雯; 王鹏飞; 汪泽文; 曹琴; 杜俊杰^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(07): 2162-2169.

DOI：10.13271/j.mpb.020.002162

• 欧李
• AP2基因家族
• 鉴定
• 表达分析

本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础，对欧李AP2家族基因进行鉴定。结果表明：AP2家族基因在欧李中有17个成员，都具有两个AP2结构域。氨基酸数在356～854之间，分子量在40 092.00～93 434.48 k D之间，等电点为4.81～9.37之间，无规则地分布在5条染色体上。二级结构多为无规则卷曲。根据亚细胞定位显示：ChAP2-7存在于细胞质中，ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11和ChAP2-15存在于细胞核中。聚类分析将其分为三大类：AP2、euANT、basal ANT，其中，ChAP2-14与At5g67180,ChAP2-16与At2g28550,ChAP2-10与At3g54320等亲缘关系最近。综合来看，AP2家族的17个基因在不同的组织和不同的品种间表达差异较大。AP2-4和AP2-6在不同组织均有表达，AP2-2,AP2-3等基因在不同组织均不表达。AP2-4和AP2-6在‘农大4号’果实中表达较高，在‘农大5号’果实中几乎不表达。本研究结果为进一步研究欧李AP2基因家族的生物学功能与利用提供参考。

• 单位
  南京农业大学; 山西农业大学