耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌噬菌体F19的分离鉴定和全基因组分析

作者：陈松建; 王山梅; 靳静^*; 王书伟; 张改; 李振江; 李敏霞; 王中全

来源：中国病原生物学杂志, 2020, 15(12): 1385-1391.

DOI：10.13350/j.cjpb.201205

• 肺炎克雷伯菌
• 耐碳青霉烯酶
• 噬菌体
• 全基因组分析

目的分析1株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19的生物学特性和全基因组。方法从肺炎患者痰液分离肺炎克雷伯菌为宿主菌分离噬菌体F19,电镜观察其形态,并绘制生长曲线,观察F19对温度及pH值的敏感性。分析F19全基因组序列,预测可能存在的开放读码框。根据F19全基因组序列构建系统进化树,进行比较基因组学分析。结果分离到1株新型的肺炎克雷伯菌噬菌体,命名为F19,F19可在其宿主菌菌苔上形成裂解性噬菌体所具有的完全透明的滴斑。电镜观察F19具典型的有尾噬菌体目短尾病毒科病毒形态特征。一步生长曲线显示F19的潜伏期为12 min,裂解量为(102±13)PFU/细胞。F19全基因组长43 766 bp,(G+C)%的含量为53.8%。预测和注释F19全基因组51个开放读码框(ORF),按照功能分为DNA复制及调控模块,噬菌体结构基因模块,裂解宿主蛋白模块3大类。比较基因组学分析F19与短尾噬菌体科Drulisvirus属噬菌体基因组具有明显相似保守框架,一致性较强。噬菌体DNA酶基因进化分析表明F19属于Drulisvirus属成员。结论从污水中分离鉴定1株新的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19,在生物学分类上属于Drulisvirus属噬菌体,为噬菌体治疗耐碳青霉烯肺炎克雷伯感染奠定了基础。

• 单位
  基础医学院; 郑州大学; 河南省人民医院; 河南医学高等专科学校