北方春糜子区糜子种质分子身份证的创建

作者：王宇卓; 王柳; 陈凌; 王海岗; 王瑞云^*; 乔治军^*

来源：山西农业科学, 2022, 50(04): 486-493.

• 糜子
• 二维码
• SSR
• 北方春糜子区
• DNA条形码

为了高效鉴定和数字化管理糜子（Panicum miliaceum L.）资源，创建糜子种质分子身份证，以来源于北方春糜子区的21份糜子资源作为试验材料，用14个高基元（四碱基重复）SSR构建分子身份证，利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数，利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化。结果表明，14对引物中8对可作为候选核心引物，8对引物共检测出等位变异24个；有效等位变异（Ne）为2.484 5～2.971 2，均值为2.719 4;Shannon多样性指数（I）为0.987 7～1.093 7，均值为1.043 7；观测杂合度（Ho）为0.526 3～0.833 3，均值为0.730 6；期望观测杂合度（He）为0.612 1～0.681 4，均值为0.648 3;Nei’s基因多样性指数（Nei）为0.597 5～0.663 4，均值为0.631 0；多态性信息含量（PIC）为0.593 3～0.760 8，均值为0.690 5。14对核心引物中剔除6对（RYW2、RYW3、RYW4、RYW7、RYW13和RYW14）与其他引物相似系数过高的引物，用8对引物组合（RYW9、RYW10、RYW8、RYW12、RYW6、RYW5、RYW11和RYW1）可将21份材料区分。8对核心引物构建了21份糜子资源的字符串和条形码，在线二维码生成器中输入各糜子的名称、统一编号、生态区、来源、字符串等信息得到糜子的二维码DNA分子身份证。

• 单位
  山西农业大学