1株三型丁香假单胞菌猕猴桃致病变种细菌全基因组扫描图测序及分析

作者：邓博涵; 刘丹蕾; 陈秋菊; 倪培恩; 张子蕾; 王大鹏; 纠松涛; 王磊; 马超; 张才喜; 王世平; 沈叶鑫; 鲍金平; 许文平^*

来源：江苏农业科学, 2020, 48(20): 67-74.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2020.20.011

• 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种
• 猕猴桃细菌性溃疡病
• 全基因组测序
• 毒力基因
• 耐药基因
• 致病基因

丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,简称Psa)是引起猕猴桃细菌性溃疡病的病原菌。对从感染溃疡病的东红猕猴桃枝条中分离得到的1株Psa野生株(命名为GX05)进行全基因组测序,获得基因组草图,分析其中毒力基因、耐药基因和致病基因的情况。研究发现,多位点序列分型结果显示GX05为biovar 3,与毒力因子数据库比对,GX05携带99种毒力因子及692个相关毒力基因,同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp1;与综合抗生素抗性基因数据库比对,GX05携带336种耐药基因,与29种抗生素有关;与病原宿主互作数据库比对,不表达导致病原菌致病力减弱的基因数量最多,其中同源性和匹配度最高的是PvdL,此外与增强致病力相关的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通过全基因组测序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐药及致病基因情况,对深入研究其致病机制和合理用药有重要意义。

• 单位
  上海交通大学