基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法

作者:周春; 吕红; 张若洋; 陈蓉; 蔡莉; 刘太香; 石宇鹏; 洪轲; 刘成成*; 梁文飚*
来源:南京医科大学学报(自然科学版), 2021, 41(03): 361-368.

摘要

目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法。方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、引物设计固定格式和引物设计软件在线设计90条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各30条),以12个插入HPA1-29W野生型和突变型序列的合成质粒以及50例已知HPA分型的献血者样本进行扩增和质谱检测,分析灵敏度、特异度和重复性,随机抽取15例样本的一代测序和质谱分型结果进行对比验证,建立检测方法。结果:基于MassARRAY平台的HPA基因分型的质谱检测方法与测序法检测结果相符合,灵敏度为100%,特异度为100%,重复性为100%。结论:成功建立基于MassARRAY平台的HPA1-29W系统的质谱分型方法,适合中国人群HPA分型,具有临床应用前景。

  • 单位
    江苏省血液中心