家蚕品种桂蚕8号亲本全基因组重测序研究初报

作者：黄文功; 浦月霞; 刘艳伟; 苏红梅; 韦博尤; 安春梅; 谭福洋; 王平阳; 闭立辉^*

来源：广西蚕业, 2022, 59(04): 18-24.

DOI：10.19553/j.cnki.1006-1657.2022.04.004

• 桂蚕8号
• 全基因组
• 重测序

对桂蚕8号4个杂交亲本“锦”（9MN）“绣”（芙H）“壮”（7MH）“丽”（87H）开展全基因组重测序研究，通过比对并作初步分析，获得4个全基因组单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失（InDel）、结构性变异（SV）和拷贝数变异（CNV）,4个杂交亲本SNP总数均超过600万个位点，插入缺失（Indel）总数约140万；在结构性变异（SV）方面，插入（INS）、缺失（DEL）、倒位（INV）、染色体内易位（ITX）和染色体间易位（CTX）类型均有存在，主要分布在基因间区、内含子、外显子、基因上游、基因下游，在可变剪切位点、UTR5、UTR3及位于一个基因的上游同时也是另一个基因的下游区间亦有分布；拷贝数偏低的区域均超200个，偏高的区域在79～100个之间，所有品种在基因上游、外显子、UTR5、基因间区均有拷贝数变异，其中以外显子区域最多，在可变剪切位点、基因下游、上游/下游、UTR3区域未见有拷贝数变异。