光核桃AmSO基因初克隆及生物信息学分析

作者：鲍馨; 李建欣; 孟凡娟^*

来源：西北农业学报, 2023, 32(11): 1745-1753.

• 光核桃
• 亚硫酸盐氧化酶
• 基因克隆
• 生物信息学分析

为了初步探索光核桃(Amygdalus mira)亚硫酸盐氧化酶(Sulfite oxidase, SO)的蛋白结构与功能，以1 a生光核桃叶片cDNA为模板，采用分子克隆技术获得光核桃AmSO基因全长为1 182 bp的开放阅读框(ORF),共编码393个氨基酸，相对分子质量是43.45 ku。生物信息学分析结果显示，AmSO蛋白是一种能在细胞核内发挥生物学作用的稳定碱性亲水蛋白，二级结构由无规则卷曲、α-螺旋和延伸链构成。蛋白结构域的预测及氨基酸序列同源性比对发现，编码氨基酸序列的N端具有氧化钼结构域，常存在于氧化还原酶中，可以与钼辅因子结合；在C端具有钼钴(Mo-co)二聚体结构域，该结构域参与二聚体的结合，并且能够参与硫、氮和碳循环中的氧化还原反应，二者在进化过程中高度保守。系统进化树分析表明AmSO与碧桃PpSO亲缘性最近，进化相对保守。对光核桃AmSO蛋白进行生物信息学预测，有助于进一步系统研究光核桃AmSO基因在生物学上的功能，为进一步了解其对非生物胁迫的响应机制奠定基础。

• 单位
  生命科学学院; 东北林业大学