基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌组织中miRNA表达变化及意义

作者：冯青青; 赵文文; 赵文飞; 于文静; 闫文娴; 魏红梅^*

来源：山东医药, 2020, 60(01): 5-16.

• 肝细胞癌
• 微小RNA
• 生物信息学
• 逆转录聚合酶链反应

目的探讨基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌(HCC)组织中微小RNA(miRNA)表达变化及意义。方法检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库、高通量基因表达数据库(GEO)中HCC相关数据集,检索时间截至2018年2月,用生物信息学分析肿瘤组织与正常组织之间miRNA的表达差异,在GEO芯片集的HCC组织中验证差异表达的miRNA。用RT-PCR检测76例份HCC及癌旁组织中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-221-5p表达,并分析二者表达与患者临床病理特征的关系。结果在GSE12717筛选出43个差异表达miRNA(P <0. 05,|Fold change|≥1),GSE10694筛选出50个差异表达miRNA(P <0. 05,|Fold change|≥0. 5),在TCGA中筛选出101个差异表达miRNA(P <0. 05,|Fold change|≥1)。hsa-miR-221-5p、hsa-miR-191-5p在两个GEO数据集中呈现差异表达,但在TCGA中未检测出二者表达差异。HCC及其癌旁组织中hsa-miR-191-5p相对表达量分别为6. 03±1. 82、0. 93±0. 08,hsa-miR-221-5p相对表达量分别为6. 03±1. 82、0. 93±0. 08。HCC组织中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-221-5p表达均高于癌旁组织(P均<0. 05)。hsa-miR-191-5p表达与HCC的TNM分期、转移复发有关(P均<0. 05),hsa-miR-221-5p表达与HCC的TNM分期、转移复发、包膜浸润有关(P均<0. 05);二者表达与患者其他临床病理特征无关(P均>0. 05)。结论基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的HCC组织中hsa-miR-191、hsamiR-221呈高表达,二者可能参与HCC的恶性进展。

• 单位
  青岛市中心医院