南方水稻黑条矮缩病苗期抗性的全基因组关联分析

作者：农保选; 秦碧霞; 夏秀忠; 杨行海; 张宗琼; 曾宇; 刘驰; 蔡健和; 谢慧婷; 崔丽贤; 罗群昌; 邓国富; 刘丕庆^*; 李丹婷^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(04): 1069-1079.

DOI：10.13271/j.mpb.017.001069

• 南方水稻黑条矮缩病
• 核心种质
• 抗性
• 全基因组关联分析
• SNP

由白背飞虱传播的南方水稻黑条矮缩病(Southern Rice Black-streaked Dwarf Virus, SRBSDV)给水稻的生产造成巨大的产量损失,开展SRBSDV抗性鉴定及全基因组关联分析,可为有效防治水稻SRBSDV提供科学依据。本研究利用人工接种方法,对419份广西地方稻种资源核心种质进行SRBSDV苗期抗性鉴定。结果表明,其SRBSDV苗期发病率变异范围为6.11%～100%,平均值为84.80%,抗性变异系数为23.29%。利用211 818个高质量SNPs对水稻SRBSDV苗期抗性进行全基因组关联分析(GWAS),共检测到10个与水稻SRBSDV苗期抗性显著相关的SNP位点,可解释7.84%～18.30%的表型变异。在所有的显著性关联SNP位点中,共检测到8个抗病基因(R基因),分别位于第1、第5及第11染色体上,可能参与SRBS-DV苗期抗性的调控。本研究结果将为水稻抗SRBSDV分子育种和抗SRBSDV基因克隆提供基础信息。

• 单位
  广西壮族自治区水牛研究所; 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所; 广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所; 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室; 广西大学