我国艰难梭菌核糖体分型库的标准化及应用

作者：张鑫; 张文竹; 李**; 赵红庆; 武艳华; 李虎; 刘正洁; 吴媛^*; 卢金星

来源：中华流行病学杂志, 2019, 40(12).

• 艰难梭菌
• 毛细管电泳
• 核糖体分型库

目的建立中国艰难梭菌核糖体分型的标准操作流程并补充和验证核糖体分型数据库, 为提高各级网络实验室数据间可比性和建立我国艰难梭菌监测网络提供解决方案。方法参照国外和本实验室已有的核糖体分型操作流程制定实验室标准核糖体分型操作程序, 建立基于BioNumerics 7.6软件分析的数据库使用方法, 应用此分型程序和数据库使用方法分析54株欧洲地区及美国标准菌株来评价该数据库, 对我国2010-2018年13个城市收集的374株艰难梭菌分离菌株进行分型以补充数据库信息, 采用Kappa一致性检验方法分析验证实验一致性强弱。结果欧洲地区及美国标准菌株的毛细管电泳结果条带清晰、位置稳定, 聚类结果快速准确;补充分型结果显示, 此次分离株中共出现84种型别, 其中25种RT型别与国外标准菌株型别一致, 而其余的58种型别不同, 并且在40种国外标准菌株型别中, 有15种型别本次分型未出现;两次验证结果一致性检验Kappa值为0.891(P<0.01), 两次测定结果具有一致性, 其一致性强度为极强。结论应用基于QIAxcel毛细管电泳仪建立的标准实验室分型操作流程, 所获得的电泳结果具有条带清晰、位置稳定的特点, 标准化后的核糖体分型库具有良好的实验室间数据可比性和数据共享便捷性。

• 单位
  河北北方学院; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所