基于SSR标记的42份樱花品种的聚类分析及DNA指纹图谱构建

作者：孙泽硕; 蒋冬月; 柳新红; 沈鑫; 李因刚; 屈雨飞; 李永华^*

来源：园艺学报, 2023, 50(03): 657-668.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2021-1057

• 樱花
• SSR
• 品种
• 聚类分析
• DNA指纹图谱

通过14对SSR引物基于UPGMA法对42份樱花品种进行聚类分析，并采用引物和基因型组合法构建DNA指纹图谱。结果表明：14对SSR引物共检测出187个等位基因，每对引物平均13.36个，有效等位基因平均6.10个，观察杂合度平均0.31，期望杂合度平均0.80,Shannon’s信息指数平均2.01，多态信息含量平均0.77；共检测出219个基因型，平均15.64个，平均区分率为22.11%。在Dice遗传相似系数约为0.18处时可分为3组，A组主要是山樱系、豆樱系和江户彼岸樱系的品种，B组是钟花樱系的品种，C组中只有尾叶樱；当Dice遗传相似系数约为0.37时，除八重红枝垂樱外，A组又可以分为6个小组。采用引物和基因型组合法构建了42份樱花品种的DNA指纹图谱，为今后樱花品种资源的分子鉴定提供依据。

• 单位
  河南农业大学; 浙江农林大学; 浙江省林业科学研究院; 园林与艺术学院