宫颈癌关键基因及其机制的生物信息学分析

作者：李瑞; 应彦祺; 张文艺; 鲁笑钦^*

来源：医学研究杂志, 2022, 51(06): 134-139.

• 宫颈癌
• 生物信息学
• 差异表达基因
• 基因拷贝数
• 免疫浸润

目的 通过生物信息方法挖掘宫颈癌的关键基因，分析其潜在作用机制。方法 从GEO数据库遴选5个基因芯片数据集(GSE63514、GSE64217、GSE6791、GSE89657和GSE9750),筛选宫颈癌差异表达基因。构建差异表达基因的PPI网络，利用Cytoscape筛选核心基因。对核心基因进行表达验证、启动子甲基化分析、基因拷贝数分析、免疫分析等。结果 通过数据集筛选出90个差异表达基因，利用PPI网络遴选出5个核心基因，分别为CDK1、CCNA2、CCNB1、CDC20和TOP2A。5个核心基因在宫颈癌中均为高表达，其mRNA表达水平与核心基因拷贝数值呈正相关(P<0.05);核心基因与宫颈癌的免疫细胞浸润有关，主要涉及CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞(P<0.05);与宫颈癌免疫分型有潜在关系，主要涉及C1型(创面愈合)、C2型(IFN-γ显性)和C4型(淋巴细胞消耗)。结论 CDK1、CCNA2、CCNB1、CDC20和TOP2A可作为宫颈癌新的生物学标志物。基因拷贝数改变可能影响核心基因的表达水平，进而改变宫颈癌患者的免疫水平。本研究为探究宫颈癌的诊断、治疗提供了新的角度。

• 单位
  郑州大学第二附属医院