肺腺癌患者外周血环状RNA差异表达谱研究

作者：穆银玉^*; 谢服役; 徐国栋; 汪春年; 方建晨

来源：中国卫生检验杂志, 2019, 29(02): 211-214.

• 肺腺癌
• 生物信息学
• 环状RNA
• 表达谱

目的筛选肺腺癌患者外周血中差异表达的环状RNA(circular RNA,circRNA),并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在肺腺癌发病中的作用。方法采用Illumina公司Solexa高通量测序对5例肺腺癌患者和5例健康对照者的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过log2foldchange和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析。结果高通量测序筛查结果提示,有4 390个circRNA在肺腺癌组和对照组之间差异有统计学意义(P <0. 05),3 009个circRNA上调,1 381个circRNA下调。对这些circRNAs所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果显示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等。对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测。结论肺腺癌患者外周血中出现许多差异表达的circRNA,circRNA可能参与肺腺癌的调控机制。

• 单位
  宁波市医疗中心李惠利医院