转录组测序分析：帕金森病小鼠PI3K、ERK和P38信号通路和代谢关系的研究

作者：刘自华; 王德贵; 李晓娟; 唐冬荣; 王雯; 陈军义; 王建林^*

来源：中华神经创伤外科电子杂志, 2021, 7(03): 161-169.

• 帕金森病
• 三磷酸腺苷
• 钙调蛋白
• 细胞外调节蛋白激酶5
• 己糖激酶1

目的研究帕金森病(PD)小鼠代谢过程中相关信号通路表达的变化。方法通过A53T小鼠和正常C57BL/6小鼠黑质部位转录组测序的方法。用Trimmomatic软件质控,hisat2软件比对基因组。cufflinks进行基因FPKM表达量定量分析;htseq-count计算表达量差异;R package进行标准化数据;GO和KEGG富集分析差异基因筛选、聚类分析和功能富集;Q-PCR验证。结果A53T小鼠与WT组比较:脂类代谢相关基因肉毒碱棕榈酰基转移酶1A(CPT1)、核酸代谢相关基因(Nme7)和糖类代谢相关基因己糖激酶1(hexokinase 1)表达减少;能量代谢相关基因三磷酸腺苷(ATP)生成减少、离子通道蛋白CaM和谷氨酸受体(GluR)表达降低;IP3R生成减少;多巴胺能受体(D2R)表达增加;信号通路相关基因P38、PI3K和ERK5表达减少。结论 PD小鼠通过PI3K、ERK和P38信号通路导致代谢水平降低。

• 单位
  基础医学院; 兰州大学第二医院; 生命科学学院; 兰州大学