土库曼蝗线粒体基因组特征及其系统发育分析

作者：马钰洁; 兰世强; 蒲雪; 季荣; 袁亮^*

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 1-13.

• 网翅蝗科
• 土库曼蝗
• 线粒体基因组
• 系统发育分析

土库曼蝗（Ramburiella turcomana）是新疆草原常见危害蝗虫。本研究基于二代测序技术获得土库曼蝗线粒体全基因组序列，并对其进行注释及特征分析。采用近邻相接法（neighbor joining method， NJ）和贝叶斯法（bayesian inference method， BI）构建网翅蝗科（Arcypteridae）系统发育树。结果表明，土库曼蝗线粒体基因为双链环状DNA，全长15 670 bp，具有明显AT偏好（72.21%），共编码37个基因，包括13个蛋白编码基因、22个tRNA编码基因、2个rRNA编码基因，以及1个非编码控制区域（D-loop区）。土库曼蝗线粒体基因组发生了蝗亚目（Locustodea）普遍存在的DK重排（DK rearrangement）现象。基于网翅蝗科已报道物种线粒体全基因组构建的NJ树和BI树具有相同的拓扑结构，其中土库曼蝗与16种网翅蝗亚科（Arcypterinae）蝗虫聚为一支，并位于网翅蝗亚科最基部，其余6种竹蝗亚科（Ceracrinae）蝗虫聚为一支，暗示土库曼蝗是网翅蝗亚科中较古老的物种。本研究公布的土库曼蝗线粒体全基因组为土库曼蝗属（Ramburiella）中首次报道，为挖掘土库曼蝗属其他物种线粒体全基因组提供分子生物学参考。

• 单位
  新疆师范大学; 生命科学学院