基于基因表达谱的银屑病自噬相关关键基因筛选和候选药物预测

作者：郭宜城; 罗美兰; 许时贵; 李小兰; 付志媛^*

来源：重庆医学, 2022, 51(24): 4263-4269+4280.

• 银屑病
• 自噬
• 自噬相关关键基因
• 信号通路
• 潜在治疗药物

目的 利用生物信息学方法探究银屑病自噬相关关键基因(Hub)和潜在治疗药物。方法 通过基因表达谱数据集筛选差异表达基因(DEGs),收集自噬相关基因(ARGs)并与DEGs取交集得到自噬相关DEGs(DEARGs),构建蛋白质-蛋白质作用网络(PPI)进行基因本体功能注释，京都基因与基因组百科全书通路富集分析，应用分子复杂检测(MCODE)算法插件筛选显著的功能模块及Hub,并经独立数据集验证，然后运用DGIdb数据库预测潜在治疗药物。结果 筛选得到39个DEARGs, DEARGs在白细胞介素-17(IL-17)调节、炎性反应调控、自噬等方面显著富集，DEARGs主要参与腺苷酸活化蛋白激酶、脂肪细胞因子、核苷酸寡聚化结构域样受体、胰岛素抵抗等通路。PPI鉴定出6个Hub,即血管紧张素Ⅱ受体1、过氧化物酶体增生激活受体γ、瘦素、脂联素、烟酰胺磷酸核糖转移酶和IL-6,受试者工作特征曲线和数据集表达分析证实了6个中枢基因与银屑病的相关性。预测了包括环孢素、阿达木单抗、利妥昔单抗、异环磷酰胺在内的77种已批准药物可作为银屑病的潜在治疗药物。结论 采用生物信息学方法鉴定Hub预测潜在治疗药物有助于了解银屑病的分子机制，为其诊治提供新的见解。

• 单位
  江西省皮肤病专科医院