基于高分辨熔解技术进行单核苷酸多态性基因分型的方法学评价

作者：尤崇革; 李玉民; 马克君; 施鑫鹤; 郜莉娜; 李菲菲

来源：中华临床医师杂志(电子版), 2012, (07): 1786-1790.

• 高分辨熔解曲线
• 基因分型
• 检验性能
• 单核苷酸多态性 High resolution melting
• Genotyping
• Detection performance
• Single nucleotide polymorphism

目的评价高分辨熔解(HRM)技术进行单核苷酸多态性(SNP)基因分型的检验性能。方法以SNP位点rs1205C>T和rs4353A>G为例,采用盲法对361例已分型确认样本进行PCR-HRM检测评价其特异性和灵敏度;通过重复试验评价其重复性和再现性。稳健性评价主要考察DNA模板量和扩增循环数对PCR-HRM检测的影响。结果 PCR-HRM法检测361例标本的rs1205C>T和rs4353A>G两个SNP位点,结果除5例样本的熔解曲线发生飘移接受复查外,其余标本均一次直接基因分型;所有标本的最终分型结果完全正确即灵敏度和特异性达到100%。两个位点的10次批内和3次批间重复试验均显示PCR-H...

• 单位
  兰州大学第二医院; 甘肃省消化系肿瘤重点实验室