科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的：研究8个国家和地区SARS-CoV-2序列的密码子使用偏好性和演化关系。方法：分别求出8个国家和地区SARS-CoV-2序列中的最大相似序列组的基准SARS-CoV-2序列，用CodonW软件分析基准SARS-CoV-2序列的密码子使用偏好，用MEGA-X软件分析各国家和地区基准SARS-CoV-2序列之间演化关系。结果：基准SARS-CoV-2序列的G+C含量均低于A+U含量，其中加拿大最低，中国次之；8个国家和地区的共有使用偏好性密码子有19个，不包括中国的有7个，不包括加拿大的有1个，不包括中国和加拿大的有1个，这总计28个密码子中有25个以A、U结尾；中国有特有偏好性密码子7个，其中6个以C、G结尾，加拿大有1个，以U结尾；3个发育树将基准SARS-CoV-2序列分成两大类，美国、印度、智利和比利时为一类，澳大利亚、加拿大、英格兰和中国为另一类，在大类中进一步划分时存在不确定性。结论：SARS-CoV-2为了适应不同宿主在不断地发生突变，与宿主发生了协同进化，呈现出多源传染、多路演化态势。
- 单位
