茄子谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶基因克隆和序列分析

作者：余桃; 孙晶; 刘莉; 邹梦倩; 王倩^*; 张爱慧^*

来源：金陵科技学院学报, 2019, 35(03): 73-77.

DOI：10.16515/j.cnki.32-1722/n.2019.03.016

• 茄子
• GSA基因
• 电子克隆
• 生物信息学分析

基于茄子基因组数据库,以番茄同源基因序列为探针,通过电子克隆手段获得茄子谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶基因,命名为SmGSA。对该基因编码蛋白从氨基酸组成、蛋白的各级结构及其理化性质等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因包含一个长度为1 044 bp的开放阅读框,共编码347个氨基酸,蛋白质分子式预测为C3 137H5 232 N1 044O1 322S211,分子量大小为85.5 KDa,为亲水性蛋白;α-螺旋、延伸链和无规卷曲是该蛋白结构的主要构成元件;该蛋白中共存在9处跨膜区,内部到外部螺旋发现4个,外部到内部螺旋发现5个。

• 单位
  金陵科技学院; 安徽农业大学