炭疽芽胞杆菌基因组中串联重复序列拷贝数的分析

作者：田国忠; 俞东征; 海荣; 魏建春; 马凤琴; 蔡虹; 张建华; 郑玉红; 付秀萍; 张志凯; 张恩民; 徐冬蕾

来源：中华微生物学和免疫学杂志, 2006, (09): 786-789.

• 炭疽芽胞杆菌
• 串联重复序列 Bacillus anthracis
• Variable-number tandem repeats

目的研究炭疽芽胞杆菌基因组中多位点串联重复序列遗传标记的遗传变异规律。方法根据文献上发表的串联重复序列位点,利用已发表的13对引物,对88株炭疽芽胞杆菌基因组DNA进行PCR扩增,扩增产物进行琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳,利用凝胶影像分析软件对PCR产物DNA片段的碱基含量进行测算,计算出串联重复拷贝数。对部分PCR扩增产物DNA片段进行测序,利用DNAStar软件进行序列比对,分析不同菌株间的串联重复序列遗传变异规律。结果(1)炭疽芽胞杆菌基因组中的串联重复序列位置,同一菌株具有相对稳定的串联重复拷贝数。(2)88株炭疽芽胞杆菌DNA上的13个串联重复序列遗传标记中,有的串联重复序列拷贝数变异...

• 单位
  传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所