EV-A71疫苗上市后广州市EV-A71基因特征分析

作者：曾庆; 耿进妹; 刘静雯; 李魁彪; 狄飚; 张晓; 谢华萍^*

来源：中国病毒病杂志, 2022, 12(05): 371-375.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2022.0071

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• VP1基因
• 系统进化分析

目的 了解广州市肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EV-A71)疫苗上市后EV-A71流行强度及VP1区基因特征。方法 采集2016—2019年广州市各区疾病预防控制中心及哨点医院上送的手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例的粪便及肛拭子样本，采用荧光逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)对样本进行总肠道病毒(enterovirus, EV)、柯萨奇病毒A16 (coxsackievirus, CVA16)和EV-A71的核酸检测，挑选EV-A71阳性样本进行病毒分离和VP1区测序。使用DNAstar7.1及MEGA6.0对序列进行分析。结果 2016—2019年共检测到肠道病毒阳性样本10 116份。EV-A71阳性样本占7.32%(740/10 116),其中，2016年占13.79%(332/2 408),2017年占15.62%(376/2 407),2018年占1.30%(31/2 376),2019年占0.03%(1/2 925)。本研究共获得37株EV-A71 VP1区完整序列，均属于C4a亚型。核苷酸相似性为91.5%～100.0%,氨基酸同源性为98.3%～100.0%。与C4a亚型参考株序列核苷酸相似性和氨基酸同源性分别为90.3%～98.4%和97.3%～100.0%;与早期广州市EV-A71核苷酸相似性和氨基酸同源性分别为90.5%～97.9%和97.6%～100.0%。通过对EV-A71 VP1区中和表位及抗原性位点比对，发现1株2017年流行株中和表位VP1-PEP27序列中发生VP1 L150V变异，抗原位点未发生变异。分子进化树显示广州市EV-A71与国内C4a亚型代表株属于同一分支，但形成多个流行簇。结论 在EV-A71疫苗上市后，广州市EV-A71检出率呈逐年降低趋势，C4a为广州市EV-A71流行的唯一基因亚型。应加强对VP1区中和表位及抗原位点的监测。

• 单位
  广州市疾病预防控制中心