大通牦牛ApoA1基因克隆及生物信息学分析与组织表达谱分析

作者：王福彬; 吴晓云; 顾亚荣; 郑青波; 马晓明; 褚敏; 阎萍; 潘和平^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(04): 752-761.

DOI：10.13417/j.gab.041.000752

• 牦牛
• ApoA1基因
• 克隆
• 生物信息学分析
• 组织表达谱分析

本试验旨在分析大通牦牛(Bos grunniens)ApoA1基因的分子特征，并检测其在不同组织的表达规律，为进一步研究ApoA1基因的功能提供理论依据。试验以牦牛肝脏cDNA为模板，通过PCR扩增和基因克隆获得牦牛ApoA1基因编码区序列(coding region sequence, CDS),并进行生物信息学分析；利用RT-qPCR技术检测ApoA1基因mRNA在心脏、肌肉、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、子宫角、脂肪和输卵管等组织中的mRNA表达水平。结果表明，大通牦牛ApoA1基因编码区序列长798 bp,编码265个氨基酸；ApoA1蛋白质的分子质量为30 324.414 Da,理论等电点为5.71;蛋白质二级结构以α-螺旋(93.58%)为主；牦牛ApoA1蛋白为不稳定亲水蛋白，存在信号肽，为分泌蛋白，不存在跨膜结构域；牦牛ApoA1基因的核苷酸序列与黄牛相应序列相似度最高，同源性为99.64%;组织表达谱分析表明，ApoA1基因在大通牦牛不同组织中都表达，但在肝脏中表达量最高，显著高于其他组织(P<0.05)。这些结果为进一步研究大通牦牛ApoA1基因在大通牦牛结构和功能及牦牛肉品质性状的遗传改良提供理论基础。

• 单位
  西北民族大学; 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所