2011和2019年甘肃省库蚊黄病毒分子遗传进化特征

作者：李彬; 查冰; 付士红; 徐学平; 应思超; 聂凯; 李兴洲^*; 王环宇^*; 梁国栋

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(02): 183-188.

DOI：10.3760/cma.j.cn112866-20220226-00045

• 库蚊
• 黄病毒
• 系统进化分析

目的揭示2011年和2019年甘肃蚊虫中库蚊黄病毒的分子遗传差异。方法使用逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction, RT-PCR)获得甘肃2011年和2019年蚊虫中库蚊黄病毒基因组核苷酸序列, 利用病毒分子生物学和生物信息学方法分析病毒基因差异。结果共获得10株库蚊黄病毒基因核苷酸序列, 包括2011年8株(均来自于淡色库蚊)、2019年2株(来自三带喙库蚊和中华按蚊)。病毒E基因核苷酸与氨基酸序列同源性分析结果显示, 甘肃2019年分离的病毒与2011年分离病毒核苷酸序列相似性98.4%～100%, 氨基酸相似性95.4%～97.3%。库蚊黄病毒E基因序列系统进化分析结果显示, 2019年甘肃分离的2株库蚊黄病毒(GS1975和GS1976)与2011年的8株库蚊黄病毒均属于基因1型B组库蚊黄病毒;2019年分离的GS1975病毒与我国辽宁(2010年和2011年)和内蒙(2018年)分离病毒处在共同的进化簇, 而2019年分离的GS1976病毒与我国内蒙(2018年)和甘肃2011年分离病毒形成共同进化簇。结论甘肃2011年和2019年分离的库蚊黄病毒均属于基因1型病毒, 2019年分离的2株病毒分布在不同的进化簇, 随着时间的推移当地库蚊黄病毒基因组在发生变化, 为此需要开展当地库蚊黄病毒分子差异的长期监测。

• 单位
  传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 公共卫生学院; 佳木斯大学