菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析

作者:谭秦亮; 蔡元保; 杨祥燕*; 李穆; 李季东; 黄思婕; 程琴; 庞新华; 朱鹏锦; 周全光
来源:热带作物学报, 2021, 42(02): 310-316.

摘要

NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用。本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1(GenBank登录号:XM020225830),对其进行生物信息学及表达分析。生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40%的α-螺旋(H)和15.30%的β-折叠(E)以及59.