利用数据库预测基因与胶质母细胞瘤的关联

作者：田宝睿; 张永超; 韩晓阳; 田颖颖; 王传玺^*

来源：山东大学学报(医学版), 2020, 58(06): 8-13.

• 胶质母细胞瘤
• 调控基因
• 诊断标志
• 生物信息学分析

目的从预后相关角度探索未被研究的胶质母细胞瘤(GBM)关键基因,并探索其作为GBM调节基因的潜力。方法基于TCGA数据库,使用GEPIA筛选预后相关基因及其表达相关基因,分析基因在GBM患者与正常人脑组织的表达模式,使用LinkedOmics分析基因与GBM患者的临床参数相关性。结果 SAMD13、FAM20C、FUCA1、RARRES1的表达与GBM患者无病生存期(DFS)和总生存期(OS)相关,同时它们在GBM患者与正常人脑组织中存在差异表达,针对其在GBM患者组织表达相关基因的京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析提示它们密切参与GBM的肿瘤形成与进展过程。结论 SAMD13、FAM20C、FUCA1、RARRES1具有成为GBM调控基因与诊断标志的潜力,它们密切参与GBM相关调控机制。

• 单位
  山东大学