巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析

作者：高静中国热带农业科学院科技信息研究所; 程汉; 蔡海滨; 安泽伟; 黄华孙

来源：热带作物学报, 2010, (09): 1439-1445.

DOI：10.3969/j.issn.1000-2561.2010.09.002

• 巴西橡胶树
• HbRD22基因
• 电子克隆
• 生物信息学 Hevea brasiliensis
• HbRD22 gene
• In silico cloning
• Bioinformatics

利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。

• 单位
  中国热带农业科学院橡胶研究所