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摘要
目的 分析黄芪治疗幽门螺杆菌（Hp）相关性消化性溃疡（PU）的靶向自噬基因生物学功能，并筛选黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬核心基因。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）并查阅文献筛选黄芪有效活性成分，在TCMSP平台和SwissTargetPrediction平台中预测其靶基因。通过GEO数据库GSE98641数据集、StarBase、miRTarBase，筛选Hp相关性PU显著性差异表达基因。在人类自噬数据库（HADb）筛选人类自噬基因。利用Venny平台获得三者交集基因，即为黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬基因。在Metascape平台对黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬基因做基因本体（GO）分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。在STRING平台构建黄芪治疗Hp相关性PU靶向自噬基因的蛋白质互作（PPI）网络，利用Cytohubba插件筛选黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬核心基因。结果 筛选得到黄芪有效活性成分的靶基因2 941个、Hp相关性PU显著性差异表达基因2 109个、人类自噬基因232个，取交集后共获得黄芪治疗Hp相关性PU靶向自噬基因16个。黄芪治疗Hp相关性PU靶向自噬基因的GO功能主要涉及细胞凋亡信号通路、有丝分裂细胞周期G1/S的转变、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物、蛋白质结构域特异性结合、蛋白激酶活性等，KEGG信号通路主要包括癌症通路、细胞凋亡通路、NOD样受体信号通路等。筛选获得TP53、CDKN1A、CCND1、CDK1、CDK2、CDK4、CCND2、E2F1、RB1、CCND3等10个黄芪治疗Hp相关性PU靶向自噬核心基因。结论 黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬基因可能通过细胞凋亡、细胞周期等生物学过程发挥作用，与癌症通路、细胞凋亡通路、NOD样受体信号通路等信号通路有关；TP53、CDKN1A、CCND1、CDK1、CDK2、CDK4、CCND2、E2F1、RB1、CCND3等10个基因可能是黄芪治疗Hp相关性PU的靶向自噬核心基因。
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