中国与美国RFLP 1-4-4 lineage1C变异株同一分支PRRSV的全基因组序列分析

作者：许浒; 李超; 相丽润; 汤艳东; 赵静; 龚帮俊; 李宛生; 付军; 彭金美; 王倩; 周国辉; 冷超粮; 安同庆; 蔡雪辉^*; 张洪亮^*; 田志军^*

来源：中国预防兽医学报, 2022, 44(02): 202-207.

• 1-4-4 PRRSV变异株
• 类NADC34 PRRSV
• 100个氨基酸缺失
• 重组病毒

2020年美国报道了高致病性的RFLP 1-4-4 lineage 1C PRRSV变异株，其对猪的致死率达到17.5%。为了分析美国1-4-4 lineage1C PRRSV变异株与中国当前流行的PRRSV的关系，本研究对中国不同基因亚型的PRRSV与美国新发1-4-4 lineage1C PRRSV变异株进行遗传演化分析，结果显示，中国类NADC34 PRRSV与美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株关系密切；其Nsp2推导氨基酸序列比对结果显示，中国类NADC34 PRRSV与美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株在Nsp2区域存在相同的分子特征，即100个氨基酸（aa328～aa427）的连续缺失。PRRSV基因重组分析结果显示，美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株是以类NADC34 IA14737-2016株为母本毒株，并由IA/2014/NADC34和NADC30病毒株提供重组基因片段的重组病毒，而中国早期的类NADC34 PRRSV是以IA/2014/NADC34株为母本毒株的重组病毒。美国早期的类NADC34 PRRSV对仔猪的致病力差异较大，而中国早期的类NADC34 PRRSV对仔猪多为中、低致病力。此外，中国HLJZD22-1812株与美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株具有类似的重组模式、相同的Nsp2缺失特征、相同的1-4-4 ORF5限制性片段长度多态性（RFLP）模式，且均属于lineage1C分支。本研究结果首次表明美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株与中国类NADC34(PRRSV)属于同一亚型分支，且具有一致的分子特征，提示类NADC34 PRRSV在我国的流行及演化情况需高度关注。

• 单位
  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 南阳师范学院; 兽医生物技术国家重点实验室