基于局域表面等离子体共振(LSPR)的核酸适配体筛选新方法的建立

作者：郝俊芳; 张英涛; 邢广旭; 王方雨^*

来源：河南农业科学, 2020, 49(03): 151-156.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.03.020

• 适配体
• LSPR-SELEX
• 链霉亲和素
• 毛细管电泳
• KD值

为了快速、高效地筛选到靶标核酸适配体,急需通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)建立一种简便、高效和可视化筛选适配体的新方法。以链霉亲和素(SA)作为靶标模型,利用局域表面等离子体共振(LSPR)和毛细管电泳(CE)相结合的方法进行筛选和验证。结果显示,在第1轮LSPR-SELEX中,筛选到SA结合的适配体(SBA),并且通过LSPR的Trace Drawer数据分析软件计算出SBA的KD值为107μmol/L;在第2轮LSPR-SELEX中,SBA的KD值为98 nmol/L。结果表明,采用LSPR-SELEX技术经2轮筛选,使SBA的亲和力提高了1 000倍。随后,将筛选到的SBA进行CE验证,结果显示, SBA适配体与其靶标SA具有良好的亲和性和特异性。综上,鉴于LSPR从初始DNA文库中分离和收集靶标适配体的高效性,LSPR-SELEX技术可用于核酸适配体的筛选。

• 单位
  河南省农业科学院; 四川农业大学; 河南省科学院生物研究所有限责任公司