甜瓜全基因组R2R3MYB转录因子基因的识别与分析

作者：张爽爽; 陈莹; 张金鹏; 耿伟; 王利波; 惠长敏^*

来源：吉林蔬菜, 2019, (02): 48-52.

DOI：10.16627/j.cnki.cn22-1215/s.2019.02.030

• 甜瓜
• R2R3MYB转录因子
• 生物信息学分析

R2R3MYB转录因子是MYB转录因子家族的一大亚类,广泛地参与植物生长发育及抵御逆境等生理过程。本文以甜瓜基因组数据为研究对象,发掘甜瓜基因组中的R2R3MYB转录因子并对其进行生物信息学分析。研究结果表明:甜瓜全基因组中含有70个具有典型结构域的R2R3MYB转录因子,蛋白序列含有氨基酸个数为166～553个不等,蛋白序列中含有保守的基序(motifs)及氨基酸位点;通过与拟南芥基因组中R2R3MYB转录因子构建亲缘进化树,对甜瓜的70个R2R3MYB转录因子基因功能进行了初步的预测。