公共卫生系统是与人民生命健康保障关联紧密的政府职能领域,该系统开展绩效管理和应急管理实践已有一定基础。通过对两类实践融通的科学价值和可行基础依次探讨,并以突发公共卫生事件处置为例分析二者融通的现实状况,发现其存在绩效管理在事件应对中被动缺位、应急管理未能充分依托绩效管理积累的历史经验、部分应急管理者绩效意识淡薄等问题。为此,应通过加强绩效信息储备与分析预测、重视应急管理规范化建设、从多个层面推动两类技术和实践体系互为参照等努力,进一步推动二者融通,提高公共卫生系统应急管理绩效。