黄瓜黑星病菌核糖体基因ITS区段的克隆及序列分析

作者：高永洋; 高观朋; 王倩倩; 王伟

来源：河南农业科学, 2009, (08): 78-83.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2009.08.028

• 黄瓜黑星病菌
• 核糖体基因转录间隔区
• 聚类组 Cladosporium cucumerinum
• Internal transcribed spacer
• Phylogenetic group

为了探讨枝孢霉属的系统发育情况,采用真菌核糖体基因转录间隔区域(ITS)通用引物,PCR扩增3株来自不同地方的黄瓜黑星病菌核糖体基因的ITS序列,并对PCR产物进行测序和序列分析。结果表明:3株黄瓜黑星病菌之间同源性为100%,ITS全长463bp,其中ITS1长154bp,5.8S rDNA长159bp,ITS2长150bp,各碱基的个数分别为G 119个、C 118个、A 120个、T 106个,GC含量为51.2%。利用MEGA4软件中的NJ法和ME法,对3个样品序列以及GenBank中登陆的枝孢霉属其他25个种构建ITS聚类分析树状图,NJ法和ME法构建的结果基本相同,枝孢霉属可以分为...

• 单位
  生物反应器工程国家重点实验室; 华东理工大学