怀玉山高山马铃薯正常种及其变种试管苗的转录组分析

作者：洪森荣^*; 朱楼兰; 陈晓恬; 衷婷霄; 郭淑贞; 谭周成; 蔡红; 陈荣华

来源：分子植物育种, 2021, 19(12): 3868-3877.

DOI：10.13271/j.mpb.019.003868

• 怀玉山高山马铃薯
• 正常种
• 变种
• 试管苗
• 转录组分析

为探究怀玉山高山马铃薯平原生境变种的机制,本研究以怀玉山高山马铃薯(麻籽洋芋)正常种(CK组)及其变种(BZ组)的试管苗为试验材料进行转录组分析。结果表明,CK组和BZ组共产生差异表达基因6 917个。GO富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用光系统Ⅰ光捕获、光合作用光捕获、蛋白质发色团连锁、酰胺生物合成过程、肽生物合成过程、光系统Ⅰ、细胞质小核糖体亚单位、光系统、大核糖体亚单位、核糖体小亚基、色素结合、叶绿素结合、结构分子活性、核糖体的结构组成、作用于糖基键的水解酶活性等功能。KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用-天线蛋白、核糖体、糖酵解、类固醇生物合成、生物素代谢、果糖和甘露糖代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、苯丙酸生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢、光合作用、谷胱甘肽代谢等代谢途径。RT-qPCR检测了10个差异基因在怀玉山高山马铃薯正常种及其变种试管苗的表达量,结果均与RNA-seq一致。本研究结果将为进行怀玉山高山马铃薯平原生境变种过程中基因表达分析提供参考。

• 单位
  上饶师范学院; 上饶市红日农业开发有限公司; 生命科学学院