基于高通量测序的真核微藻多样性质控分析

作者：宋伦; 吴景; 李楠; 孙明; 杜静; 王鹏^*

来源：水产科学, 2019, 38(06): 804-812.

DOI：10.16378/j.cnki.1003-1111.2019.06.009

• 真核微藻
• 高通量测序
• 褐潮
• 多样性
• 质控分析
• 辽东湾

利用测序数据质量、序列聚类水平、测序数据量的合理性探讨,对辽东湾真核微藻进行高通量测序,比较不同序列聚类水平对真核微藻多样性研究的影响,以期进一步优化真核微藻的分子鉴定技术。结果发现,辽东湾17个站位每个样品获得的高质量序列数均超过87%,用于注释的序列数中碱基占比超过97%,表明测得的数据准确可靠。97%序列聚类水平对目标物种丰度的鉴定准确度较高,也会降低对物种多样性的高估。利用稀释曲线和等级聚类曲线可评估测序数据量的合理性,当曲线趋向平坦,说明测序数据量渐进合理,增加测序数据量浪费时间和成本,辽东湾的测序量无论站位评估还是组内评估均达到合理水平。根据高通量测序结果,整理了种水平辽东湾浮游植物名录、分布及特性,名录包含90种藻类,其中7种可导致鱼类死亡,25种引发过赤潮或褐潮,21种含有毒素。

• 单位
  辽宁省海洋水产科学研究院; 哈尔滨工业大学; 城市水资源与水环境国家重点实验室