铁型腈水合酶降解苯甲腈的分子模拟研究

作者:张娱; 刘智峰; 陈明; 唐志书; 刘世军; 许洪波
来源:环境科学与技术, 2018, 41(12): 37-41.
DOI:10.19672/j.cnki.1003-6504.2018.12.006

摘要

为探索铁型腈水合酶降解腈的微观降解机制,文章用分子对接的方法模拟了铁型腈水合酶与腈的相互作用,得到它们复合物结构的理论模型,根据打分函数最低原则筛选出的铁型腈水合酶ReNHase与苯甲腈之间最佳构象打分函数为-64.881 5,二次打分函数为-56.663 1。并应用LPC/CSU server研究最佳构象的相互作用情况,结果表明,ReNHase与苯甲腈之间以疏水作用数量最多,ReNHase的PRO125 A、ILE24 B、LEU123 A和THR27 B在催化过程中起到了重要作用。

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