溶藻弧菌HY9901外膜蛋白OmpH的基因克隆及其生物信息学分析

作者：周泽军; 庞欢瑛; 丁燏; 简纪常; 吴灶和

来源：生物技术通报, 2013, (04): 116-122.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2013.04.011

• 溶藻弧菌
• 基因克隆
• OmpH基因
• 外膜蛋白
• 生物信息学分析 Vibrio alginolyticus
• Gene cloning
• OmpH gene
• Outer membrane protein
• Bioinformatics analysis

根据已发表的溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)全基因组序列设计1对特异性引物,PCR扩增溶藻弧菌HY9901株外膜蛋白OmpH的全长基因。结果显示,该基因(GenBank登录号:JX855924)全长573 bp,共编码190个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子量约为21.1 kD,等电点为9.02。SignalP 4.0、TMHMM Server 2.0和SofiBerry-Psite预测结果显示,OmpH不存在信号肽与跨膜区,含有1个N-糖基化位点,6个磷酸化位点,1个内质网靶信号位点以及3个微体C末端靶信号位点。利用MAGE5.0软件,以邻位相连法构建OmpH系...

• 单位
  广东省教育厅; 广东海洋大学; 仲恺农业工程学院