青稞硝酸盐转运蛋白基因HvnNPF4.5的克隆和亚细胞定位

作者：刘凡语; 安立昆; 姚晓华; 姚有华; 崔永梅; 白羿雄; 李新; 吴昆仑^*

来源：湖南农业科学, 2022, (11): 1-7.

DOI：10.16498/j.cnki.hnnykx.2022.011.001

• 青稞
• 硝酸盐转运蛋白
• HvnNPF4.5基因
• 生物信息学分析

植物硝酸盐转运蛋白家族NPFs(Nitrate Transpoter1/Peptide Transporter Family)属于一类低亲和硝酸盐转运蛋白家族，在植物氮素吸收和转运过程中发挥着重要作用，NPFs基因家族是目前植物氮素吸收、转运和同化相关基因家族研究的热点。该研究从“昆仑14”青稞中克隆了HvnNPF4.5基因和其启动子区域序列，并对HvnNPF4.5基因和蛋白结构、系统进化和亚细胞定位进行了研究。结果表明：HvnNPF4.5基因序列含有2个内含子，启动子区域有与干旱以及脱落酸、赤霉素、生长素相关的顺式作用元件；HvnNPF4.5蛋白由614个氨基酸组成，分子量为66 875.31 Da，总原子数为9 465个，亲水系数为0.317，理论等电点为8.85，不稳定指数36.98，脂溶性指数为100.43，有8个磷酸化位点和12个跨膜结构，没有信号肽；HvnNPF4.5蛋白二级结构中α螺旋、延长链、β转角、无规则卷曲分别占48.83%、11.83%、3.5%、35.83%；HvnNPF4.5和其他物种的同源蛋白都有MFS结构域，将HvnNPF4.5与其他植物的氨基酸序列进行比较并构建系统进化树，发现青稞HvnNPF4.5与大麦HvNPF4.5、节节麦AtsNPF4.5的亲缘关系最近；亚细胞定位结果显示HvNPF4.5定位在细胞膜上。

• 单位
  青海大学