摘要
蓖麻油是重要的生物能源,主要成分是三酰甘油。磷脂:甾醇酰基转移酶1-2(Phospholipids: Diacylglycerol Acyltransferase, RcPDAT1-2)是蓖麻三酰甘油非依赖酰基-CoA途径合成的关键调节基因。为加深对RcPDAT1-2的了解,本研究应用生物信息学方法,对蓖麻RcPDAT1-2蛋白进行研究和分析。通过序列比对和进化树分析,大戟科植物PDAT家族蛋白相似度很高,PDAT蛋白可分为三个亚家族,PDAT1类、PDAT2类和LCAT类,RcPDAT1-2蛋白与巴西橡胶树HbPDAT1、麻疯树JcPDAT1的遗传距离较近。通过同源蛋白序列和空间构象比对,RcPDAT1-2蛋白可分为三个区域:α/β水解酶活性区、膜结合区和活性中心帽结构域。发现4个残基位点C141、H242、S243和M244高度保守,在维持蛋白稳定、保持蛋白功能活性等方面的具有重要作用。RcPDAT1-2蛋白为跨膜蛋白,N端含有跨膜区,不含有信号肽,亚细胞定位分析蛋白定位于质膜,这和甾醇酰基转移酶类蛋白参与膜磷脂转化三酰甘油的生物机制关系密切。本研究的实施,为下一步RcPDAT1-2蛋白结构与功能研究,以及蓖麻油酸合成途径基因改造提供了重要依据。
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