猎蝽科昆虫线粒体基因组的比较研究

作者：赵婉清; 李巧; 李莹; 杨柳; 郑茜之; 张虎芳^*

来源：江苏农业科学, 2022, 50(12): 34-41.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.12.006

• 猎蝽科
• 线粒体基因组
• 比较基因组学
• 系统发育
• 分子标记
• 基因重排
• 碱基组成
• 密码子使用偏好性

线粒体基因组是系统发育常用的分子标记，本研究旨在对猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行比较研究，着重分析基因重排、碱基组成、密码子使用偏好性等特征，并构建基于13个蛋白编码基因的系统发育关系。在GenBank数据库下载猎蝽科11亚科30属代表物种的线粒体基因组序列，通过Geneious 8.0.4抽提各编码基因的序列。利用MEGA 7.0统计碱基组成、氨基酸和核苷酸序列信息位点、起始密码子、终止密码子、相对密码子使用频率(RSCU)等序列基本信息。另外，利用DnaSP 6.0计算蛋白编码基因的非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks),并通过Ka/Ks值比较基因的核苷酸进化速率。通过jModelTest选择进化模型，在MrBayes 3.2.2软件中构建基于贝叶斯法(BI)的系统发育树。结果表明：猎蝽科线粒体基因组均呈共线性结构，没有发现大面积的基因重排现象，只有部分序列中rrnS和trnT基因编码方向与原始序列编码方向相反，trnR和cytb基因出现多拷贝的现象。猎蝽科线粒体最常使用ATN起始密码子和TAA终止密码子。BI系统发育树对猎蝽科各亚科之间的关系进行了一定的解析，光猎蝽亚科(Ectrichodiinae)和猎蝽亚科(Reduviinae)为并系群，真猎蝽亚科(Harpactorinae)和锥猎蝽亚科(Triatominae)为单系群。本研究为猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行了比较分析，为后续研究该科系统发生关系奠定了科学基础。

• 单位
  忻州师范学院