摘要
目的:对1株新的变形杆菌(Proteus)噬菌体进行分离、鉴定与生物学特性及基因组分析。方法:将实验室从牦牛屠宰环节中分离到的菌株纯培养后,对其DNA提取进行16S rRNA测序,鉴定获得宿主菌,采集四川成都牦牛屠宰场环境污水,以获得的宿主菌进行噬菌体分离;运用双层琼脂平板法进行噬菌体的分离纯化,测定噬菌体的最佳感染复数、一步生长曲线和噬菌体耐受性等;通过磷酸负染、透射电镜观察噬菌体的形态;采用试剂盒提取噬菌体全基因组DNA,使用Illumina MiSeq测序平台进行噬菌体全基因组测序,对噬菌体全基因组序列进行组装、注释和基因组学分析。结果:从67株分离菌株中鉴定出10株Proteus,并从污水中分离得到1株可裂解变形杆菌和粪肠球菌(Enterococcus faecalis)并且裂解性较强的噬菌体,命名为Proteus phage PV66;其最佳感染复数为0.1,一步生长曲线结果显示,感染宿主菌的潜伏期约为10 min,裂解期约为80 min,平均裂解量为321 PFU/cell;耐受pH值范围为3~12,耐受温度为65℃。电镜观察该噬菌体为C3形态噬菌体,其头部长(140±1)nm、宽(54±2)nm,尾部长为(36±1)nm。基因组测序结果表明PV66全序列长度为90 492 bp,系统发育树分析发现该噬菌体与奇异变形杆菌(P. mirabilis)噬菌体和克诺罗杆菌(Cronobacter)噬菌体同源性较高,与non-Kuravirus属处于同一分支。结论:本研究分离到1株新的变形杆菌噬菌体并具有良好的应用潜力,为进一步开发噬菌体类新型抗菌剂提供基础,同时也丰富了变形杆菌噬菌体的数据库。
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