吉林省2001~2014年麻疹病毒血凝素蛋白基因变异分析

作者:周剑惠; 单元春; 王爽; 田鑫; 杨尧; 程涛; 魏雷雷; 曹凤瑞; 付思美; 吕淑梅
来源:中国疫苗和免疫, 2016, 22(05): 493-497.
DOI:10.19914/j.cjvi.2016.05.003

摘要

目的研究吉林省20012014年麻疹病毒血凝素(H)蛋白的变异情况。方法选取吉林省20012014年21株麻疹病毒株,通过病毒分离、核酸提取、逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增得到H蛋白基因片段,测序并拼接全序,用生物信息学软件进行变异分析。结果吉林省20012014年21株麻疹病毒株均为H1a基因亚型,与中国疫苗株S191相比,H蛋白的核苷酸变异率由2001年的4.69%逐年上升到2013年的5.34%,氨基酸变异率由4.05%逐年上升到5.02%。与H1a中国代表株China93-4相比,核苷酸变异率从0.38%逐步上升为1.14%,氨基酸变异率从0.49%逐步上升为1.41%。吉林省麻疹病毒株均保留了4个糖基化位点,第240位氨基酸均由丝氨酸变为天冬酰胺,导致第5个糖基化位点NLS238240缺失。21株麻疹病毒H蛋白氨基酸的334、397、493、574、592、603、613和614位点熵值相对偏高,可变性相对较大。结论吉林省20012014年麻疹病毒的核苷酸和氨基酸变异率均呈逐年升高趋势,需持续监测关键区域位点变异情况。

  • 单位
    吉林省卫生监测检验中心; 吉林省疾病预防控制中心

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