基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究

作者：左文明; 曾阳; 杨春芳; 李美雎; 李锦萍^*; 刘力宽^*

来源：中草药, 2019, 50(22): 5545-5553.

• 蓼科
• 唐古特大黄
• 高通量
• 叶绿体
• 叶绿体全基因组

目的获得野生唐古特大黄叶绿体全基因组信息特征,并对相关物种亲缘关系进行研究。方法本实验采用Illumina高通量测序技术构建了唐古特大黄叶绿体全基因组图谱。结果唐古特大黄基因组大小为161 054 bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为86 441 bp和12 745 bp,反向互补重复区(IR)大小为30 934 bp,共注释叶绿体基因132个,包括88个蛋白编码基因,36个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因,其中每个IR区19个。结论选取唐古特大黄在内的7个蓼科物种、4个其他科物种构建系统发育树,形态极其相似的唐古特大黄与掌叶大黄在分子上亲缘关系也最近,但rpl32等基因存在差异位点,对有效区分近缘物种提供新依据。

• 单位
  生命科学学院; 青海师范大学