转录组测序筛选山羊妊娠早期胚胎附植相关基因

作者：骆金红; 陈祥^*; 尚以顺; 敖叶; 李鹏程

来源：畜牧兽医学报, 2022, 53(05): 1465-1474.

• 努比亚山羊
• 妊娠早期
• 子宫角
• 胚胎附植
• 转录组测序

旨在通过胚胎附植前、后的山羊子宫角组织高通量测序筛选妊娠早期胚胎附植的关键基因。本研究选取2～4岁体重相近((44.76±3.49)kg)的经产努比亚母山羊16只，在同期发情-人工输精配种后的第15(D15)和第30天(D30)分别随机选取3只羊颈动脉放血处死。采集子宫角组织利用Illumina HiSeq进行高通量转录组测序(RNA-Seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)并对DEGs进行功能注释，基因功能查询进一步筛选与胚胎附植直接相关的调控基因，荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选的基因进行表达量验证分析。D15和D30子宫角组织转录本比较分析发现了2 000个DEGs,其中上调基因620个，下调基因1 380个。GO功能聚类分析共分为3大类52组，其中细胞组分17组，生物过程23组，分子功能12组，获得细胞连接与增殖，生物粘附与调节，分子活性与转导等重要生物途径。以D15表达量高低为排序标准，从表达量最高的10个基因中筛选出了与胚胎附植有关的基因MGP和TAGLN;从上调和下调幅度最大的前10个差异表达基因中，获得参与妊娠相关糖蛋白合成与分泌的基因PAG-3、PAG-8、PAG-12,参与生长因子结合与生长激素释放激素受体活性相关基因GHRHR和胰岛素样生长因子结合蛋白基因IGFBP1。qRT-PCR结果显示，随机选取的6个基因在D15和D30子宫角中表达变化趋势与RNA-Seq结果一致。获得的基因MGP、TAGLN、PAG-3、PAG-8、PAG-12、GHRHR、IGFBP1在努比亚山羊胚胎附植中具有重要作用。

• 单位
  贵州大学; 贵州省农业科学院; 动物科学学院