阿拉善双峰驼MSTN基因序列生物信息学分析

作者：杨惠; 额尔敦木图; 姜建强; 刘图雅; 戴钦; 阿拉腾呼依嘎; 白龙

来源：黑龙江畜牧兽医, 2018, (01): 41-250.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2017.05.0166

• 阿拉善双峰驼
• 肌肉生长抑制素(MSTN)
• 基因序列
• 蛋白质
• 生物信息学

为了研究阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN)基因,进一步探讨阿拉善双峰驼MSTN基因的结构及功能,试验采用5对引物对阿拉善双峰驼MSTN基因进行PCR扩增,所得产物进行序列拼接,利用生物信息学方法对阿拉善双峰驼MSTN基因的结构、理化性质及其编码蛋白信号肽、跨膜位置、亚细胞定位等进行分析,并讨论了阿拉善双峰驼与其他物种MSTN氨基酸序列的进化关系。结果表明:阿拉善双峰驼MSTN基因长7.3 kb,1581 bp为第一外显子区,2 3842 757 bp为第二外显子区,4 8006 737 bp为第三外显子区。阿拉善双峰驼MSTN蛋白属于疏水性不稳定蛋白,1819位氨基酸是最有可能的剪切位点,作为信号肽的可能性很大;二级结构中α-螺旋占22.40%,延伸链占26.67%,β-转角占7.73%,无规则卷曲占43.20%;阿拉善双峰驼MSTN蛋白有1个跨膜结构区域,其功能域可能位于278375位氨基酸处。阿拉善双峰驼MSTN基因与哺乳类及灵长类动物的亲缘关系较近,与猪的亲缘关系最近(相似性高达99.2%)。说明阿拉善双峰驼MSTN基因编码的蛋白符合一般TGF-β超家族的结构特征,并符合已知MSTN蛋白的结构特征,与猪、灵长类及反刍类动物的分子进化距离较近。

• 单位
  内蒙古农业大学; 农业部