龙眼体胚发生过程HD-Zip全基因组与生物功能分析

作者:张春渝; 徐小萍; 陈晓慧; 张舒婷; 张梓浩; 陈裕坤; 林玉玲; 赖钟雄*
来源:园艺与种苗, 2019, 39(06): 27-32.
DOI:10.16530/j.cnki.cn21-1574/s.2019.06.009

摘要

[目的]了解龙眼HD-Zip基因家族的结构特征以及在不同体胚及不同组织器官中的作用。[方法]采用生物信息学分析方法对龙眼HD-Zip基因家族进行基因鉴定。对其蛋白质结构域及性质、内含子外显子结构位置分布、系统进化树、保守基序和结构域以及在体胚发生早期不同阶段和不同组织中基因表达的FPKM值进行分析。[结果]龙眼HD-Zip基因家族有18个成员,分为4个亚家族,各家族的氨基酸数目不同,等电点介于4.70~9.37,基因家族的内含子数目可能与家族分类有关,且此基因家族具有多个保守的结构域。龙眼HD-Zip基因在不同的体胚与组织器官中表达模式多样。[结论]龙眼HD-Zip家族基因可能参与胚胎发育与组织器官的形成,展现其功能的多样性。

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